Le Comité des Ministres est l'organe directeur de l'Organisation. Il est composé des ministres des Affaires étrangères des États membres du Conseil de l'Europe ou de leurs représentants permanents. Le Comité des Ministres examine les mesures qui doivent être prises pour atteindre l'objectif du Conseil de l'Europe, y compris la conclusion de conventions ou d'accords et l'adoption par les gouvernements d'une politique commune sur des questions spécifiques. Les conclusions du Comité sont communiquées aux membres du Conseil par le Secrétaire général.
Dans les cas échéants, les conclusions du Comité peuvent prendre la forme de recommandations aux gouvernements des États membres du Conseil, et le Comité peut inviter les gouvernements des États membres du Conseil à l'informer des mesures qu'ils ont prises pour mettre en œuvre ces recommandations.
Le Comité des Ministres peut créer des comités ou des commissions consultatifs et techniques pour la réalisation d'objectifs spécifiques qu'il juge appropriés.
Sauf décision contraire du Comité des Ministres, ses réunions se tiennent à huis clos au Siège du Conseil de l'Europe à Strasbourg. Le Comité des Ministres décide quelles informations sur la discussion qui a eu lieu en séance privée et les conclusions qui en étaient tirées doivent être diffusées.
Les ministres exercent la présidence du Comité à tour de rôle, par ordre alphabétique des États membres en anglais, pour une durée de six mois. La transition de la présidence a lieu à la mi-mai et à la mi-novembre.
Les réunions du Comité des Ministres se tiennent une fois par an au niveau des Ministres des Affaires étrangères et une fois par semaine au niveau des Délégués (Représentants permanents des États membres du Conseil de l’Europe).
Traditionnellement, les sessions du Comité des Ministres au niveau des ministres des affaires étrangères se tiennent dans la capitale de la présidence, qui s'achève. Les sessions se composent de deux parties : une session formelle et des discussions informelles.
L'ordre du jour de la session comprend généralement:
questions institutionnelles liées à la transition de la présidence (présentation des réalisations de la fin de la présidence et présentation des priorités de la future présidence; date et lieu de la prochaine session);
un sujet de débat spécifique. La présidence, qui se termine par la prochaine présidence, propose les sujets de discussion les plus pertinents;
questions nécessitant une décision au niveau ministériel, après les travaux menés pendant la période de présidence de six mois;
si nécessaire, un document complétant le consensus international sur un sujet spécifique peut être proposé pour adoption.
Les sessions du Comité des Ministres au niveau des députés (Représentants permanents des États membres du CE) se déroulent selon un calendrier approuvé chaque automne.
Les décisions prises par les députés ont la même valeur que les décisions prises par le Comité des Ministres lors d'une réunion au niveau des ministres des Affaires étrangères. Cependant, les députés ne décident pas de questions qui, malgré la position d'un ou plusieurs participants, doivent être tranchées lors de la réunion ministérielle du Comité des Ministres.
Un représentant de l'UE et des représentants des États observateurs assistent aux réunions.
Les réunions du Comité des Ministres sur la surveillance de l'exécution des arrêts de la Cour européenne des droits de l'homme
Au moins quatre fois par an, le Comité des Ministres tient des réunions sur les droits de l'homme (DH) au niveau des députés. Ces réunions durent deux ou trois jours. Lors de ses réunions, le Comité des Ministres examine en détail l'état de mise en œuvre par les États membres des arrêts de la Cour dans les affaires dirigées contre eux.
Le Bureau du Comité des Ministres, créé en mars 1975, facilite le travail du Comité des Ministres au niveau des députés. Depuis mai 2001, le Bureau est composé de six membres classés par ordre alphabétique anglais: le président actuel, deux anciens présidents et trois futurs.
Le Bureau n'est pas habilité à prendre des décisions sur des questions de fond.
Parmi les principales tâches du Bureau figurent:
fournir un appui consultatif au président sur le déroulement des réunions, les déclarations politiques, la nomination des présidents des groupes de rapporteurs;
la préparation des réunions;
les contacts avec l'Assemblée parlementaire;
la représentation du Comité des Ministres lors de réunions et d’échanges de vues.
Les groupes de rapporteurs du Comité des Ministres sont des organes de travail informels et n'ont pas de pouvoir de décision. Ils préparent les décisions du Comité des Ministres pour adoption, idéalement sans débat.
Les groupes d'orateurs suivants sont actuellement en place
GR-C - Education, Culture, Sport, Jeunesse et Environnement
GR-DEM - Démocratie
GR-EXT - Relations extérieures
GR-H - Droits de l’homme
GR-J - Coopération juridique
GR-PBA - Programme, Budget et Administration
GR-SOC - Questions sociales et de santé
En outre, les groupes de rapporteurs assurent une interaction efficace avec l'APCE, le Congrès, les comités directeurs (auxquels participent des experts sectoriels des États membres), les conférences ministérielles spécialisées et leurs comités préparatoires.